Chromium單細胞基因表達解決方案能夠提供單細胞轉錄組3'基因表達和多組學功能，可同時對成千上萬個細胞進行分析。通過結合單細胞水平的基因表達、細胞表面蛋白表達或CRISPR編輯，可以探索細胞異質性，鑒定新的靶點及生物標志物。
| 高通量單細胞分析 |
| 多組學細胞讀數(shù) |
| 可擴展的功能基因組學 |
捕獲樣本中成千上萬個細胞的完整異質性。 | 可檢測3’ mRNA、細胞表面蛋白、CRISPR擾動及其他。 | 通過配對的CRISPR敲除和全轉錄組讀數(shù)來探索基因網絡。 | |||
| 簡化的數(shù)據分析 |
| 為期一天的實驗室流程 |
| 兼容不同的樣本 |
| 使用易用的軟件來探索和解釋單細胞基因表達譜。 | 在一天之內完成從樣本到可測序文庫的過程。 | 經驗證適用于固定、新鮮和冷凍的樣本，以及完整的細胞和細胞核。 |
通過單細胞多組學探索您的應用
靈活的解決方案 滿足您各種需求
 | 單細胞基因表達的標準 |
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開啟您的單細胞基因表達實驗--使用可以負擔的適用于小型項目的解決方案進行試點研究或優(yōu)化實驗條件。
| 單細胞基因表達低通量解決方案 |
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| 開啟您的單細胞發(fā)現(xiàn)之旅。僅需100-1,000個細胞即可進行試點研究，啟動初步研究或進行樣本制備優(yōu)化。 | ||
| 觀看產品網絡研討會 > | ||
獲得初步見解 | 優(yōu)化樣本制備 | 從樣本制備到數(shù)據分析的全面支持 |
通過小規(guī)模研究，從100-1,000個細胞中找到可揭示的內容。 | 優(yōu)化實驗條件，提高您的研究成功率。 | 從技術資源到用戶友好的基于云的數(shù)據分析都將為您提供端到端的支持。 |
同時測量細胞表面蛋白表達或CRISPR擾動與基因表達。
| CRISPR篩選 |  |
通過對細胞內sgRNA的直接捕獲和基因表達的變化，以單細胞分辨率評估CRISPR擾動帶來的影響。 | |
| 查看信息圖 > | |
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| 細胞表面蛋白 | |
綜合分析單細胞的基因和蛋白表達，以便發(fā)現(xiàn)新的細胞亞群和罕見的細胞群體。 | |
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單細胞基因表達Flex
Chromium單細胞基因表達Flex能夠提供單細胞基因表達和混樣功能，以分析數(shù)百到一百萬個細胞。在樣本采集點進行固定可保留脆弱樣本的生物學特征，并大大簡化工作流程，帶來更多樣本的生物學見解。
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通過Chromium Connect 單細胞基因表達解決方案獲得一致性高、重復性好的結果，大大提高實驗室生產力。
| 自動化單細胞基因表達解決方案 | ||
| 基于Chromium Connect的自動化基因表達工作流程，助力您探索異質性，發(fā)現(xiàn)新的目標和生物標志物，并以提高生產力來揭示復雜的細胞過程。 | | |
優(yōu)化生產力 | 將您的工作流程標準化 | 流線操作 |
縮短手動操作時間，從單細胞到可以測序的基因表達文庫，實現(xiàn)無人值守的便捷。 | 在多個實驗室、用戶、甚至多個站點生成一致且可重復的單細胞基因表達結果。 | 采用預先分裝的自動化專屬試劑，這些試劑采用顏色編碼和2D條形碼，用于防錯試劑跟蹤和加載。 |
完整的解決方案
基于Next GEM技術的Chromium儀器 Chromium X Series 通量靈活、可拓展 Chromium Controller 小巧靈活 Chromium Connect 自動化 |
Chromium單細胞基因表達試劑 利用我們的試劑盒，您可以捕獲和擴增3’ mRNA，鑒定CRISPR擾動或開展其他應用。 |
分析和可視化軟件
Cell Ranger 數(shù)據分析流程 Loupe Browser 數(shù)據可視化軟件 |
世界級的技術支持和客戶支持 您可以通過電話或電子郵件聯(lián)系我們的 專家支持團隊。 |
工作流程
單細胞基因表達的基本工作流程如下所示。若您使用我們的Feature Barcode試劑盒來分析CRISPR或細胞表面蛋白，我們將會提供其他方案用于修飾您感興趣的蛋白。
樣本制備 從成百上千個細胞開始。按照洗滌、計數(shù)和濃縮細胞的高效做法，盡量減少細胞團塊的存在，回收高質量的單細胞懸液。 |
文庫構建 利用我們的試劑盒和Chromium Controller構建帶有10x條形碼的文庫。 Chromium Controller將每個帶有10x條形碼的凝膠珠的細胞封裝在單個液滴中。在每個納升級的液滴中，細胞經過逆轉錄生成cDNA，其中單個細胞的所有cDNA都帶有共同的10x條形碼。 |
測序 第2步所生成的10x條形碼文庫與Illumina測序儀上的標準短讀長NGS測序兼容，能夠實現(xiàn)數(shù)千個單細胞的大規(guī)模轉錄分析。 |
數(shù)據分析 我們的Cell Ranger分析軟件可生成每個細胞的表達譜，鑒定表達譜相似的細胞簇，還能夠對多個樣本的數(shù)據進行合并分析。 分析流程輸出 輸出結果包括質控信息和文件，這些文件可輕松用于Loupe可視化軟件或第三方R工具及Python工具的進一步分析。 |
數(shù)據可視化 利用我們的Loupe Browser可視化軟件，您可以交互式地探索實驗結果，研究目的基因的表達模式，確定細胞類型，并開展細胞簇和樣本之間的比較分析。 只有生物信息專家才能使用嗎？ Loupe是點選式軟件，任何人都可以輕松下載和使用。 |
常 見 問 題
Chromium單細胞基因表達能夠實現(xiàn)哪種分析？
它提供了一種全面的方法，來分析基因表達（全轉錄組或靶向），以及細胞表面蛋白或CRISPR編輯對復雜生物學的多維見解。
能夠分析哪些類型的RNA？
只要是表達聚腺苷酸化mRNA分子的細胞類型，都與該單細胞RNA-seq流程兼容。
與哪些類型的樣本兼容？
Chromium單細胞基因表達與新鮮、固定（甲醇）和冷凍的單細胞或單細胞核懸液兼容。兼容的物種包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。
如何分析我的單細胞數(shù)據？
10x Genomics提供了兩種類型的軟件，可幫助您分析數(shù)據：Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger這款分析軟件能夠自動生成每個細胞的表達譜，并鑒定表達譜相似的細胞簇。隨后，您可以利用Loupe Browser可視化軟件來交互式地探索實驗結果。您可以從10x支持網站上免費下載Cell Ranger和Loupe Browser。
細胞大小是否存在限制？
我們在內部測試了直徑達到30微米的細胞。此外，許多客戶文獻也成功證明了對各類細胞的兼容性，如肝細胞、成纖維細胞和心肌細胞，它們的大小往往超過30微米。
相 關 產 品
產品 | 單細胞基因表達 |
單細胞免疫分析 |
空間基因表達 |
單細胞ATAC |
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| 擴展應用 |
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